Dr.
Karolis Martinkus
Publications
-
GraphChef: Decision-Tree Recipes to Explain Graph Neural Networks
Peter Müller, Lukas Faber, Karolis Martinkus and Roger Wattenhofer.
12th International Conference on Learning Representations (ICLR), Vienna, Austria, May 2024.
BibTeX -
Efficient and Scalable Graph Generation through Iterative Local Expansion
Andreas Bergmeister, Karolis Martinkus, Nathanaël Perraudin and Roger Wattenhofer.
12th International Conference on Learning Representations (ICLR), Vienna, Austria, May 2024.
BibTeX -
Automating Rigid Origami Design (Best paper in AI&Arts track)
Jeremia Geiger, Karolis Martinkus, Oliver Richter and Roger Wattenhofer.
32nd International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI), Macau, China, August 2023.
BibTeX -
GraphChef: Learning the Recipe of Your Dataset
Peter Müller, Lukas Faber, Karolis Martinkus and Roger Wattenhofer.
Workshop on Interpretable ML in Healthcare at International Conference on Machine Learning, Honolulu, Hawaii, July 2023.
BibTeX -
Discovering Graph Generation Algorithms
Mihai Babiac, Karolis Martinkus and Roger Wattenhofer.
Neurosymbolic Generative Models Workshop (NeSy-GeMs @ ICLR 2023), Kigali, Rwanda, May 2023.
BibTeX -
Agent-Based Graph Neural Networks
Karolis Martinkus, Pál András Papp, Benedikt Schesch and Roger Wattenhofer.
11th International Conference on Learning Representations (ICLR), Kigali, Rwanda, May 2023.
BibTeX -
Diffusion Models for Graphs Benefit From Discrete State Spaces (Extended Abstract)
Kilian Konstantin Haefeli, Karolis Martinkus, Nathanaël Perraudin and Roger Wattenhofer.
First Learning on Graphs Conference (LoG 2022), Virtual, December 2022.
External BibTeX -
Automating Rigid Origami Design
Jeremia Geiger, Karolis Martinkus, Oliver Richter and Roger Wattenhofer.
ICML Workshop on Machine Learning for Computational Design (MLCD), Baltimore, Maryland, USA, July 2022.
BibTeX -
SPECTRE: Spectral Conditioning Overcomes the Expressivity Limits of One-shot Graph Generators
Karolis Martinkus, Andreas Loukas, Nathanaël Perraudin and Roger Wattenhofer.
39th International Conference on Machine Learning (ICML), Baltimore, Maryland, USA, July 2022.
BibTeX -
On Isotropy Calibration of Transformers
Yue Ding, Karolis Martinkus, Damian Pascual, Simon Clematide and Roger Wattenhofer.
3rd Workshop on Insights from Negative Results in NLP (Insights @ ACL 2022), Dublin, Ireland, May 2022.
External BibTeX -
DropGNN: Random Dropouts Increase the Expressiveness of Graph Neural Networks (Spotlight)
Pál András Papp, Karolis Martinkus, Lukas Faber and Roger Wattenhofer.
35th Conference on Neural Information Processing Systems (NeurIPS), Virtual, December 2021.
BibTeX -
Scalable Graph Networks for Particle Simulations
Karolis Martinkus, Aurelien Lucchi and Nathanaël Perraudin.
35th Conference on Artificial Intelligence (AAAI), Virtual, February 2021.
BibTeX
Theses & Labs
Past Theses & Labs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Title | Type | Contact/Supervisor | Assigned | Student(s) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | From Pixels to Nodes: A Segmentation-Driven Approach to Image Classification | G | Karolis Martinkus, Ard Kastrati | FS 23 | , , | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Adversarial Robustness of Expressive Graph Neural Networks | B | Karolis Martinkus | FS 23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Efficient Neural Representation Learning for Star-Convex Boundaries [confidential] | S | Karolis Martinkus | FS 23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Efficient and Scalable Graph Generation by Spectrum Preserving Local Expansion [confidential] | M | Karolis Martinkus | FS 23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Graph-based Metrics and Approaches for Sketch Generation [confidential] | M | Karolis Martinkus | FS 23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Contrastive Learning using SPECTRE for Generating Graph Augmentations | S | Karolis Martinkus, Zhao Meng | HS 22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Developing Interpretable Graph Neural Networks for High Dimensional Feature Spaces | B | Karolis Martinkus, Lukas Faber | HS 22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Node-level Prediction Tasks with Agent-based Graph Neural Networks | B | Karolis Martinkus | HS 22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Spectral Denoising Diffusion Probabilistic Models for Graphs [confidential] | S | Karolis Martinkus | HS 22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Discrete Denoising Diffusion Probabilistic Models for Graphs [confidential] | B | Karolis Martinkus | FS 22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Vector-Quantized Generative Adversarial Networks for Graphs | M | Karolis Martinkus | FS 22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Discovering Graph Generation Algorithms [confidential] | M | Karolis Martinkus | FS 22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Agent-based Graph Neural Network [confidential] | S | Karolis Martinkus | HS 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Distributed Asynchronous Policy (DAP) with RL [confidential] | M | Karolis Martinkus, Lukas Faber | HS 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | CloudMLS: A Cloud-based E2EE scheme | M | Karolis Martinkus, Ard Kastrati | HS 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Interpretable Graph Neural Network [confidential] | M | Karolis Martinkus, Lukas Faber | HS 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Scaling Attention Using Binary Trees [confidential] | M | Karolis Martinkus | HS 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Distance Preserving Graph Embedding | B | Karolis Martinkus | FS 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | End to End Encryption in a Cloud-Based Messenger [confidential] | S | Ard Kastrati, Karolis Martinkus | FS 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Graph Coloring with Deep Learning [confidential] | S | Karolis Martinkus | FS 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Enhancing Graph Neural Networks with Boosting | B | Lukas Faber, Karolis Martinkus | FS 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | Neural Distance Oracle for Road Graphs | B | Karolis Martinkus | FS 21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | On Isotropy Calibration of Transformer Models [confidential] | M | Damian Pascual, Karolis Martinkus | HS 20 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 | A Rigid Origami Environment for Reinforcement Learning [confidential] | M | Oliver Richter, Karolis Martinkus | HS 20 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||